- Las cajas que son viejas son para tí.
(defining) Son para tí sólo las cajas que son viejas. Hay otras cajas que no son viejas.
The boxes which are old are for you.
El which se puede sustituir por that pero no se puede omitir porque funciona como sujeto. Si funcionara como objeto sí se podría omitir.
- Las cajas, que son viejas, son para tí.
(non-defining) Todas las cajas son para tí y, además, digo que son viejas (todas).
The boxes, which are old, are for you.
El which no se puede sustituir por that y nunca se puede omitir. La frase de relativo va entre comas.